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出版商嘗試讓科學家為在線文章寫評論

2016-01-07 09:31:33

來源:《中國科學報》

原標題:“讓全世界的知識可以交流”

  出版商嘗試讓科學家為在線文章寫評論

  對在線研究論文進行批注,甚至能夠改變論文的寫作方式以及同行評議和發(fā)表情況。

  The Project Twins制圖

  如果軟件允許科學家進行網(wǎng)上評論批注,他們是否愿意為在線研究成果寫注解、訂正或是評語?非營利組織Hypothes.is創(chuàng)始人Dan Whaley認為,科學家會這樣做。

  Whaley的公司搭建了一個開放軟件平臺,可以讓用戶標識出文本,或是在網(wǎng)頁及PDF文件上進行批注。2015年12月1日,Hypothes.is宣布和40多家出版商、科技公司以及學術網(wǎng)站合作,其中包括威立出版社、美國公共科學圖書館、跨庫檢索CrossRef、預印本文庫arXiv等。

  Whaley希望這樣的合作能夠鼓勵研究人員開始批注全球在線學術資料??茖W家可以對研究論文進行評論,同時能夠公開或在私下里分享這些批注,而且教育工作者可以利用注解在課堂上互動交流。如果這個想法可以啟動,一些熱心人表示,對在線研究論文進行批注,甚至能夠改變論文的寫作方式以及同行評議和發(fā)表情況。Hypothes.is于2011年受慈善基金資助在加州舊金山成立,該公司有著雄心勃勃的目標:“讓全世界的知識可以交流?!?/p>

  在線批注

  該網(wǎng)站成立之初就提出了在線批注的概念。讓網(wǎng)頁讀者批注在線文本的想法從1993年就有了,早期的Mosaic瀏覽器(全球最早一款可顯示圖片的瀏覽器)就擁有這項功能。然而,該功能最終被拋棄了。今天,系統(tǒng)默認的可以讓讀者在其網(wǎng)頁上進行注解的網(wǎng)站寥寥無幾,其中博客平臺Medium算是一家,還有學術參考資料管理系統(tǒng)F1000 Workspace以及新網(wǎng)站Quartz也具有這項功能。然而,這些批注僅能被上述網(wǎng)站的用戶看到。而其他的一些批注服務網(wǎng)站,如A.nnotate或是Google Docs,都需要用戶上傳資料到云端服務器,才可以分享注解與評論。

  Hypothes.is并不是唯一一家希望讓用戶可以便捷地在整個網(wǎng)頁上進行注解的服務網(wǎng)站。另外一個叫作Genius的網(wǎng)絡注解服務器也可以對饒舌音樂進行批注。去年4月,該網(wǎng)站發(fā)起了諸如瀏覽器插件目錄等服務,幫助用戶批注任何一種網(wǎng)頁。但是和hypothes.is不同,Genius的代碼并不是開放源的,其服務不能和PDF文件兼容,而且也不適用于學術界。在學術領域,參考文獻管理工具ReadCube能讓網(wǎng)絡讀者注解PDF文檔,但是這種軟件是私人擁有的。

  相比較來看,Hypothes.is平臺的開放源特征意味著任何人都能夠利用其創(chuàng)建注釋,就像人們用標準技術創(chuàng)建其網(wǎng)頁那樣。該公司還是萬維網(wǎng)聯(lián)盟(制定注釋標準及其交流方式的網(wǎng)絡標準機構)的成員之一。該網(wǎng)站希望,允許注釋的網(wǎng)頁能夠采用同樣的標準和原則,使該功能方便使用和互動。該工作組已經(jīng)公布了其標準的一個草擬版本,并有望在2016年末完成。

  運行方式

  現(xiàn)在,Hypothes.is用戶有若干種選擇創(chuàng)建及查看注釋。這些選擇包括瀏覽器書簽、瀏覽器工具條或者是添加“via.hypothes.is/”到任何統(tǒng)一資源定位符的開頭。

  當Hypothes.is用戶打開一個網(wǎng)頁之后,例如一篇學術文章,網(wǎng)絡瀏覽器會顯示用戶能夠看到的任何批注。那些表示高度強調(diào)的詞匯以及評價會出現(xiàn)在文本的最上方,用戶能夠在此基礎上增加他們自己的評論,就像學生在教科書上做記號那樣。系統(tǒng)會默認這些注解是公開的,但是它們也能夠選擇作為不開放的個人評論。去年11月3日系統(tǒng)升級后,批注還可以在私人群組之間進行分享。這將會讓這些工具被用于期刊俱樂部、課堂訓練,甚至是同行評議。

  如果做過注解后,一個網(wǎng)頁發(fā)生了變化,那么軟件就會利用“模糊控制”邏輯,將注解與其原文中的近似處相匹配。該系統(tǒng)還可以用于標注從HTML超文本標記語言到PDF轉換過程,反之亦然。

  相關注解被儲存在Hypothes.is的服務器上,Whaley表示,2015年,服務器已經(jīng)記錄了來自約1萬名用戶的25萬條左右的評論和注釋。例如,在2015年10月颶風帕特里娜發(fā)生后,氣候?qū)W家對mashable網(wǎng)站許多開放獲取的文章作了大量評論。Whaley補充說,如果出版商希望自己處理這些注釋,或是公司希望對相關注釋保密,可以通過同樣的軟件平臺管理它們自己的服務器。

  合作搭檔

  現(xiàn)在,Hypothes.is的用戶已經(jīng)能夠批注任何網(wǎng)頁——包括研究論文和他們可以看到的付費閱讀文章。近日公布的正式合作伙伴關系見證了一些出版商為鼓勵科研人員進行在線批注付出的努力,包括處理讓批注系統(tǒng)磕絆難行的一些內(nèi)容,比如網(wǎng)頁頁面和內(nèi)嵌讀物等。

  例如,JSTOR數(shù)字圖書館正在研發(fā)一種Hypothes.is定制的工具,并將其用于伊利諾伊州芝加哥文學組織和出版商全國詩作基金會教育的項目。紐約JSTOR實驗室主任Alex Humphreys說,教師可以用該工具在課堂上為詩歌作注解。他們可以選擇要作批注的詩歌,然后用復本建立一個專用頁面,并限制只有該班集體能夠看到這些注解。學生也能夠建立個人注解,并在小組內(nèi)分享。Humphreys表示,該工具即將登場。

  英國劍橋大學科學出版商eLife也對使用Hypothes.is代替同行評議系統(tǒng)的可行性進行了測試,該公司技術主管Ian Mulvany說。eLife計劃把一個重新設計的系統(tǒng)與注解平臺合并,用來代替其目前使用的評論系統(tǒng)Disqus。Mulvany表示,至少Hypothes.is為多目標評論提供了一種機制,相當于把評論從一個網(wǎng)頁的底部移到了文章的主體部分。

  還有一個合作伙伴是由紐約康奈爾大學圖書館管理的arXiv預印本文庫,該機構已經(jīng)在研究讓注解可以在多個不同的文章版本中流動,信息學家、arXiv技術研發(fā)部主任Simeon Warner說。

  不只是“涂鴉”

  Hypothes.is計劃采取措施改善其平臺,包括驗證評論人的身份,其方法是通過并入研究人員獨特的ORCID(開放研究者和作者用戶標識)數(shù)字檔案。通過促進科學家對出版文獻的評論,過濾掉不需要的空白區(qū)域,將會把學術人員使用該系統(tǒng)的狀態(tài)向前推進一大步,arXiv創(chuàng)始人、康奈爾大學物理學家Paul Ginsparg說:“如果人們開始閱讀文章,他們看到了這些類似于涂鴉的評論,并將其關掉,結果他們的實驗可能失敗。”

  如果這一措施啟動,在線注解將會代表學術交流方式產(chǎn)生的根本性轉變,該團隊成員、澳大利亞珀斯科廷大學文化與技術中心的Cameron Neylon說。Neylon解釋說,目前學術出版過程常常需要把文件從一個地方搬到另一個地方。研究人員準備手稿,和同事分享稿件,加入評論,然后將其遞交給出版商;期刊編輯把復本給同行評議研究人員審核、把他們的評語返還給作者;作者然后再和期刊編輯反復通信,直到修改完終稿;文章發(fā)表后,讀者會對其進行評論。

  Neylon表示,利用開放源注解平臺,文章就是注意力的焦點。隨著時間的發(fā)展,評論會變得越來越多,不同的貢獻者可以通過改變誰有權看到文章以及評論來管理內(nèi)容?!澳憧赡馨堰@當成一種讓那些評論可以在時間上和不同版本上自由移動的結構,而我們以前從來沒有這么做過?!彼f。

  但是Ginsparg指出,并不清楚研究人員是否愿意在線注解,即便技術允許他們可以對評論保密或是讓評論在小組內(nèi)分享。“現(xiàn)在,讓科學家廣泛進行在線評論注解仍缺乏激勵措施?!彼f,“這也是一項需要開展的實驗?!?strong>(紅楓)

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